我们知道，SELinux 是预先配置的，可以在不进行任何手动配置的情况下使用 SELinux 功能。然而，一般来说，预先配置的 SELinux 设置很难满足所有的 Linux 系统安全需求。
SELinux 配置只能有 root 用户进行设置和修改。配置和策略文件位于 /etc/selinux 目录中，主配置文件位 /etc/selinux/config 文件，该文件中的内容如下：
[root@localhost ~]# vim /etc/selinux/config
# This file controls the state of SELinux on the system.
# SELINUX= can take one of these three values：
# enforcing - SELinux security policy is enforced.
# permissive - SELinux prints warnings instead of enforcing.
# disabled - No SELinux policy is loaded.
SELINUX=enforcing
#指定SELinux的运行模式。有enforcing（强制模式）、permissive（宽容模式）、disabled（不生效）三种模式
# SELINUXTYPE= can take one of these two values：
# targeted - Targeted processes are protected，
# mls - Multi Level Security protection.
SELINUXTYPE=targeted
#指定SELinux的默认策略。有 targeted（针对性保护策略，是默认策略）和 mls（多级安全保护策略）两种策略
主配置文件中，除去以‘#’符号开头的注释行，有效配置参数仅有 2 行。其中，SELinux=enforcing 为 SELinux 默认的工作模式，有效值还可以是 permissive 和 disabled；SELINUXTYPE=targeted 用于指定 SELinux 的默认策略。
有关 SELinux 3中工作默认的介绍，可以阅读《SELinux的工作模式》一节；有关 SELinux 策略，可阅读《SELinux Targeted、MLS和Minimum策略》一节。
这里需要注意，如果从强制模式（enforcing）、宽容模式（permissive）切换到关闭模式（disabled），或者从关闭模式切换到其他两种模式，则必须重启 Linux 系统才能生效，但是强制模式和宽容模式这两种模式互相切换不用重启 Linux 系统就可以生效。这是因为 SELinux 是整合到 Linux 内核中的，所以必须重启才能正确关闭和启动。而且，如果从关闭模式切换到启动模式，那么重启 Linux 系统的速度会比较慢，那是因为需要重新写入安全上下文信息。